More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4964 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4578  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter transport system, substrate binding protein  60 
 
 
575 aa  702  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.364144  hitchhiker  0.00551772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4964  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
571 aa  1185  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000193242  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  30.09 
 
 
544 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  28.09 
 
 
532 aa  144  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.91 
 
 
544 aa  144  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
523 aa  142  2e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  28.09 
 
 
532 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.82 
 
 
542 aa  141  4e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 
514 aa  137  7e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
514 aa  136  1e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 
531 aa  135  2e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 
502 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
532 aa  132  1e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.93 
 
 
521 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
532 aa  131  4e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
532 aa  131  4e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 
507 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.93 
 
 
521 aa  130  7e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 
510 aa  130  7e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
521 aa  130  7e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  27.8 
 
 
533 aa  130  7e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.93 
 
 
521 aa  130  7e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.93 
 
 
521 aa  130  7e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 
534 aa  129  2e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.67 
 
 
524 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 
514 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
568 aa  127  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 
547 aa  127  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  27.33 
 
 
533 aa  127  8e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.76 
 
 
530 aa  126  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.57 
 
 
547 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  27.33 
 
 
537 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
547 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
520 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
520 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
530 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
520 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  27.79 
 
 
537 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
528 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
532 aa  123  1e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
520 aa  122  1e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.54 
 
 
541 aa  122  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
531 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
521 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
493 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
520 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  29.02 
 
 
529 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.43 
 
 
509 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.91 
 
 
565 aa  120  4e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
538 aa  121  4e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
549 aa  120  5e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.6 
 
 
508 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
532 aa  120  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.09 
 
 
531 aa  120  8e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.9 
 
 
532 aa  119  1e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.74 
 
 
520 aa  119  1e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
519 aa  119  2e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  29.89 
 
 
522 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
541 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.79 
 
 
535 aa  118  4e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
531 aa  117  4e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
524 aa  117  7e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.09 
 
 
540 aa  117  7e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.48 
 
 
520 aa  117  8e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  26.68 
 
 
519 aa  117  8e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
542 aa  116  9e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  26.26 
 
 
517 aa  116  9e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.38 
 
 
535 aa  116  1e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.64 
 
 
521 aa  116  1e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
512 aa  116  1e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.17 
 
 
520 aa  116  1e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  26.38 
 
 
535 aa  116  1e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  26.38 
 
 
535 aa  116  1e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
547 aa  115  2e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
522 aa  115  2e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
520 aa  115  2e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
543 aa  115  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
520 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
532 aa  115  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
535 aa  114  4e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
541 aa  114  4e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.89 
 
 
525 aa  114  4e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 
531 aa  114  4e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
530 aa  114  4e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
517 aa  114  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
531 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
530 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
531 aa  114  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
595 aa  113  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
545 aa  113  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.3 
 
 
520 aa  113  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
538 aa  112  1e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
520 aa  112  1e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 
526 aa  113  1e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0130  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 
542 aa  113  1e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 
517 aa  112  1e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26 
 
 
512 aa  112  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26 
 
 
512 aa  112  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
535 aa  112  2e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 
520 aa  112  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>