More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0059 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  100 
 
 		 385 aa  759    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  81.16 
 
 		 373 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  67.8 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  70.19 
 
 		 375 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  67.92 
 
 		 373 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  69.92 
 
 		 375 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  66.04 
 
 		 373 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  61.48 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  49.73 
 
 		 385 aa  322  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  52.09 
 
 		 385 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  51.53 
 
 		 381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  51.81 
 
 		 385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  51.25 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  51.25 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  51.25 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  51.25 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  51.25 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  51.25 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  47.59 
 
 		 373 aa  302  7.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  51.25 
 
 		 374 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  48.68 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  46.67 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  47.51 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  44.13 
 
 		 406 aa  293  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 344 aa  252  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  47.01 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  44.63 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  42.9 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 342 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  40.36 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 348 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  37.26 
 
 		 347 aa  206  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  37.6 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 353 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  35.75 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  30.97 
 
 		 328 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  30.62 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  29.74 
 
 		 326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  28.37 
 
 		 324 aa  123  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  31.96 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  29.62 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  30.42 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 350 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  31.41 
 
 		 353 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  30 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  30 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.22 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  30.25 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.36 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3431  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 342 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  28.18 
 
 		 394 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  28.18 
 
 		 394 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  32.48 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  32.48 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  32.48 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  32.48 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  32.48 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  32.48 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  29.17 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  29.33 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  32.48 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  32.48 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  27.9 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  30.06 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  32.37 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  28.61 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  29.33 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  30.46 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.13 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  29.36 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  26.67 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3408  Monosaccharide-transporting ATPase  30.46 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  29.94 
 
 		 332 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1676  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 849 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.586191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 393 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  32.08 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  27.58 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  32.08 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  32.08 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>