More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004224 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  100 
 
 		 267 aa  552  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  89.14 
 
 		 267 aa  502  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  68 
 
 		 263 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  59.6 
 
 		 269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  53.46 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  53.88 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  50 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  48.87 
 
 		 278 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  47.91 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  51.01 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  50.21 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  50 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  45.19 
 
 		 281 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  47.03 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  47.03 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  47.03 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  43.98 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  47.03 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  43.98 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  43.98 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  43.98 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  42.36 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  39.39 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  41.4 
 
 		 311 aa  195  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  37.45 
 
 		 290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  37.66 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  41.11 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  47.52 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  39.07 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  39.69 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  47.43 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  39.91 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  45.66 
 
 		 381 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  41.99 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  41.41 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 417 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  49.39 
 
 		 324 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  34.27 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  50.96 
 
 		 423 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  46.63 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  49.15 
 
 		 471 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  47.12 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  44.02 
 
 		 370 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  44.86 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  36.7 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  36.7 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  36.76 
 
 		 333 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  45.51 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  47.31 
 
 		 337 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  45.55 
 
 		 342 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  49.08 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  43.01 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  35.5 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  43.55 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  48.63 
 
 		 394 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  49.09 
 
 		 325 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 335 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  43.55 
 
 		 333 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  42.62 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  39.53 
 
 		 259 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  48.51 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  48.51 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  48.51 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  47.71 
 
 		 352 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  36.49 
 
 		 259 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  43.26 
 
 		 388 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  39.58 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  44.25 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  38.38 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  44.6 
 
 		 409 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  38.19 
 
 		 238 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  45.88 
 
 		 419 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  57.26 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  45.88 
 
 		 421 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  53.57 
 
 		 468 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  42.77 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  40.88 
 
 		 361 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  44.91 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  51.79 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  58 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  51.79 
 
 		 474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  45.27 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  43.89 
 
 		 424 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  38.97 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  37.74 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  35.71 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  58 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  41.85 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  46.11 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  58 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  41.76 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  58 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  42.77 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  41.24 
 
 		 398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  58 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  41.82 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>