70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000061 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  100 
 
 		 560 aa  1155    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  47.51 
 
 		 582 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  45.44 
 
 		 594 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  37.76 
 
 		 1027 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  39.31 
 
 		 1022 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  29.8 
 
 		 653 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  29.07 
 
 		 653 aa  207  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  29.1 
 
 		 653 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  34.71 
 
 		 721 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4369  hypothetical protein  38.24 
 
 		 646 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  44.83 
 
 		 1597 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  26.25 
 
 		 765 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  37.65 
 
 		 1287 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  40.86 
 
 		 1268 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  35.45 
 
 		 2478 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  37.21 
 
 		 1363 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  37.72 
 
 		 1269 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2894  lectin repeat domain protein  25.08 
 
 		 801 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.106224  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.58 
 
 		 3363 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  35.9 
 
 		 1269 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  35.63 
 
 		 4848 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  29.37 
 
 		 1040 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  35.35 
 
 		 2816 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.29 
 
 		 4220 aa  54.3  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  27.94 
 
 		 601 aa  54.3  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.08 
 
 		 4978 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  35.35 
 
 		 892 aa  53.9  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  36.54 
 
 		 1394 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  33.33 
 
 		 1367 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.65 
 
 		 1109 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  38.1 
 
 		 3474 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.97 
 
 		 2377 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  34.19 
 
 		 3477 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.19 
 
 		 761 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.98 
 
 		 850 aa  51.6  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1126 aa  51.6  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  31.97 
 
 		 814 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2698  Ricin B lectin  23.91 
 
 		 803 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0894708  normal  0.0551726 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  34.07 
 
 		 2602 aa  50.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.52 
 
 		 5745 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.52 
 
 		 994 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  25.31 
 
 		 1178 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 		 982 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 1502 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.7 
 
 		 2114 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  37.68 
 
 		 2848 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  29.81 
 
 		 2267 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3504  hypothetical protein  22.59 
 
 		 385 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.208979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  35.19 
 
 		 3089 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2767 aa  47.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  32.26 
 
 		 1215 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  32.26 
 
 		 1215 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1066 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  34.88 
 
 		 4748 aa  47.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  30.83 
 
 		 1911 aa  47.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1538 aa  47.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  26.09 
 
 		 663 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.35 
 
 		 2839 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  30.1 
 
 		 8321 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.38 
 
 		 3471 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  32.95 
 
 		 3544 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 		 1283 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  35.53 
 
 		 4896 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  29.03 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.09 
 
 		 2476 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.33 
 
 		 1884 aa  45.8  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  40.74 
 
 		 1712 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  31.08 
 
 		 16322 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1061 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.63 
 
 		 3793 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>