More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1291 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 470 aa  967    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  37.41 
 
 		 452 aa  320  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  36.34 
 
 		 464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  36.58 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.89 
 
 		 451 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  36.67 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.29 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  30.17 
 
 		 431 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.47 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.49 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 466 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  32.17 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  32.17 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.96 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1360  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 478 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.937812  normal  0.278157 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 463 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 463 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.18 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 441 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 454 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 431 aa  93.6  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  22.83 
 
 		 461 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 446 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 429 aa  92.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 443 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.41 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.78 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.59 
 
 		 427 aa  90.5  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  22.58 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  29.39 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 446 aa  90.1  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.13 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.51 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.23 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.95 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  29.89 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.68 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.89 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>