More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0752 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
310 aa  615  1e-175  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  41.36 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  38.26 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 
318 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  37.76 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  39.74 
 
 
305 aa  152  5e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  37.41 
 
 
289 aa  135  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  36.25 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 
308 aa  129  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  33.58 
 
 
269 aa  123  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  35.59 
 
 
295 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  32.24 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  33.66 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  34.62 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  32.89 
 
 
290 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  29.53 
 
 
345 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  29.97 
 
 
291 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  28.9 
 
 
297 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  29.41 
 
 
283 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2270  PfkB domain protein  36.07 
 
 
387 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  31.99 
 
 
321 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  35.23 
 
 
300 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  31.74 
 
 
307 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  31.05 
 
 
304 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  29.28 
 
 
303 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  26.17 
 
 
302 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  26.47 
 
 
308 aa  100  3e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  29.8 
 
 
327 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  26.53 
 
 
298 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  31.91 
 
 
295 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  27.18 
 
 
302 aa  99.4  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  36.54 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  34.25 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  26.83 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.48 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  28.25 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 
315 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  30.94 
 
 
310 aa  95.9  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  29.97 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  26.64 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  32.57 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  27.42 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  26.64 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  28.87 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  29.43 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.33 
 
 
309 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  30.45 
 
 
315 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  32.89 
 
 
302 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.8 
 
 
315 aa  94  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  30.67 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  34.11 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  26.4 
 
 
308 aa  93.6  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  32.04 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  27.96 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  28.24 
 
 
297 aa  92.4  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  30.51 
 
 
304 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  29.61 
 
 
300 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0480  PfkB domain protein  29.08 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.68 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  31.72 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  30.46 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  29.78 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  30.95 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  31.19 
 
 
293 aa  89.7  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 
309 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  35.31 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  26.91 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  29.9 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  29.9 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  31.56 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  30.52 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  29.57 
 
 
302 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  30.16 
 
 
309 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  30.43 
 
 
299 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  31.02 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  26.82 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.12 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.18 
 
 
305 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.76 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.99 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.69 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  29.43 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  30.03 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  29.9 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  33.44 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  29.37 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  29.21 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  29.39 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  31.76 
 
 
297 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  29.63 
 
 
299 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  33.45 
 
 
304 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  34.72 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  29.14 
 
 
303 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  27.15 
 
 
306 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  30.79 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  29.14 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  30 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  26.23 
 
 
403 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>