216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1001 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 427 aa  881    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  45.94 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  45.04 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  41.81 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  40.24 
 
 		 445 aa  315  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  40.85 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  37.82 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  34.28 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  32.74 
 
 		 422 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  34.81 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.91 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  30.15 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  30.68 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  28.61 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 414 aa  156  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 631 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.6 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  31.88 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  22.64 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  23.26 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  23.89 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.88 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.97 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.05 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.81 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  20.62 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>