58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1093 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  100 
 
 		 428 aa  852    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  91.36 
 
 		 428 aa  796    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  61.48 
 
 		 442 aa  549  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  65.55 
 
 		 435 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  35.26 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.06 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  32.05 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  30.2 
 
 		 401 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.97 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  30.19 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.43 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 398 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  23.43 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  31.62 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  23.63 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  27.44 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  23.51 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.08 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  23.43 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29.37 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  20.36 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.87 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 339 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  29.36 
 
 		 354 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 307 aa  51.2  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  23.81 
 
 		 335 aa  51.2  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 322 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  24.77 
 
 		 379 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  23.02 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 688 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  28.86 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.57 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  27.31 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  26.73 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  23.45 
 
 		 689 aa  44.3  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  23.83 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  23.83 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  23.42 
 
 		 347 aa  44.3  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  23.83 
 
 		 315 aa  43.9  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  52.17 
 
 		 374 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  27.15 
 
 		 382 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  22.12 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>