More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2631 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 178 aa  352  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  82.02 
 
 		 178 aa  298  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  72.78 
 
 		 180 aa  258  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  67.22 
 
 		 180 aa  244  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  67.04 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  67.98 
 
 		 178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  65.17 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  64.61 
 
 		 178 aa  241  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  66.48 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  67.42 
 
 		 178 aa  239  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  67.04 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  65.92 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  65.92 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  62.92 
 
 		 178 aa  231  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  62.01 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 178 aa  228  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  63.24 
 
 		 185 aa  227  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 178 aa  221  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  63.13 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  63.13 
 
 		 180 aa  217  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  60 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  55.62 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  57.06 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  57.87 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  56.22 
 
 		 187 aa  205  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  58.66 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 179 aa  204  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  204  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 180 aa  199  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.93 
 
 		 178 aa  200  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  55.14 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 181 aa  198  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1722  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0239785  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  197  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  57.71 
 
 		 177 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 182 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 178 aa  194  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0266  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 179 aa  194  7e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 182 aa  193  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  191  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  190  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000953175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>