More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1726 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  71.2 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  61.11 
 
 		 230 aa  264  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  63.21 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  63.69 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  55.5 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  62.42 
 
 		 183 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  57.14 
 
 		 182 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  55.76 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  53.89 
 
 		 173 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  54.17 
 
 		 195 aa  164  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  49.47 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  55.49 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  49.18 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  50 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  52.41 
 
 		 190 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  52.3 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  53.61 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  50.94 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  48.28 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  50.29 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  47.98 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  47.98 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  47.98 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  47.85 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  47.37 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  44.09 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  49.42 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  49.1 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  47.83 
 
 		 162 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  43.68 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  46.34 
 
 		 162 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  46.58 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  47.24 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  43.1 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  44.44 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  44.81 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  42.86 
 
 		 167 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  42.17 
 
 		 168 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  48.17 
 
 		 197 aa  121  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  41.38 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  42.17 
 
 		 167 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  55.91 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  41.72 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  44.44 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  40.74 
 
 		 169 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  40.74 
 
 		 169 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  40.74 
 
 		 169 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  40.74 
 
 		 169 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  40.74 
 
 		 169 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  44.59 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  42.86 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  39.41 
 
 		 168 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  40.96 
 
 		 168 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  40.96 
 
 		 168 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  40.96 
 
 		 168 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  39.02 
 
 		 170 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  39.02 
 
 		 170 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  39.02 
 
 		 170 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  45.4 
 
 		 181 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  39.29 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  42.42 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  41.61 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  39.51 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  39.51 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  39.51 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  39.51 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  39.51 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  39.51 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  39.51 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  41.22 
 
 		 170 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  39.51 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  39.51 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  46.84 
 
 		 184 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  41.21 
 
 		 186 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  42.94 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  44.38 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  41.42 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  40.36 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  39.39 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  39.39 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  39.39 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  42.42 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  43.03 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  40 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  39.39 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  41.94 
 
 		 154 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  40.41 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  40 
 
 		 172 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.29 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.29 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  38.89 
 
 		 169 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  39.24 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  37.8 
 
 		 162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  42.36 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  41.55 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  44 
 
 		 170 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  44.08 
 
 		 168 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  39.52 
 
 		 168 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  42.68 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>