More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3822 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  41.07 
 
 
3158 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  39.35 
 
 
3930 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  42.38 
 
 
3679 aa  771    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  42.07 
 
 
1548 aa  718    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  40.78 
 
 
2107 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  39.16 
 
 
2376 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  39.81 
 
 
3463 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 
7110 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.48 
 
 
1101 aa  758    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.04 
 
 
2230 aa  714    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  44.89 
 
 
3427 aa  773    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.08 
 
 
6889 aa  648    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.39 
 
 
2136 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
3092 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.46 
 
 
1867 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  40.27 
 
 
1939 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  43.87 
 
 
1337 aa  1110    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  43.17 
 
 
3254 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 
7210 aa  724    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  37.02 
 
 
1208 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  41.23 
 
 
1424 aa  653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.5 
 
 
2551 aa  1054    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.67 
 
 
1874 aa  1034    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  49.23 
 
 
1656 aa  918    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  43.46 
 
 
1144 aa  743    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  50.05 
 
 
1587 aa  980    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  41.97 
 
 
2333 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  41.04 
 
 
2047 aa  707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  44.32 
 
 
2880 aa  759    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  42.67 
 
 
2367 aa  701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  43.63 
 
 
4080 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  39.93 
 
 
3252 aa  707    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  39.39 
 
 
2890 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 
5154 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
5400 aa  696    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  40.09 
 
 
2126 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  38.91 
 
 
2081 aa  672    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  39.53 
 
 
2113 aa  671    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  39.17 
 
 
4165 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  49.45 
 
 
2762 aa  901    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.41 
 
 
2078 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  38.75 
 
 
2374 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  43.15 
 
 
3693 aa  799    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  42.17 
 
 
4151 aa  692    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.29 
 
 
1559 aa  997    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3100  Acyl transferase  47.47 
 
 
866 aa  783    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304625  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  38.74 
 
 
3449 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  48.06 
 
 
2462 aa  845    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  48.09 
 
 
3176 aa  889    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.12 
 
 
1372 aa  775    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  52.03 
 
 
2551 aa  952    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  51.39 
 
 
1909 aa  937    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1354 aa  2793    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  38.27 
 
 
2134 aa  644    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  39.29 
 
 
3711 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  39 
 
 
2985 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.84 
 
 
1126 aa  666    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  38.99 
 
 
1966 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 
1816 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  46.64 
 
 
4478 aa  871    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  42.81 
 
 
3424 aa  739    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  39.9 
 
 
1955 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  43.15 
 
 
3693 aa  799    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  37.68 
 
 
1402 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.81 
 
 
1837 aa  669    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.68 
 
 
950 aa  728    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  47.62 
 
 
1087 aa  1001    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  36.76 
 
 
1071 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  42.96 
 
 
3676 aa  788    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  41.92 
 
 
2477 aa  741    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  44.95 
 
 
3696 aa  787    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  41.15 
 
 
4882 aa  678    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  40.4 
 
 
3670 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  44.03 
 
 
3337 aa  754    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  42 
 
 
1602 aa  698    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  47.73 
 
 
3645 aa  816    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  48.92 
 
 
1349 aa  923    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  51.97 
 
 
1559 aa  991    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  39.22 
 
 
3033 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  42.44 
 
 
2232 aa  725    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  41.47 
 
 
7279 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  40.74 
 
 
3494 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.98 
 
 
1909 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  43.36 
 
 
3130 aa  748    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  43.09 
 
 
3702 aa  797    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.36 
 
 
1804 aa  704    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.98 
 
 
1349 aa  924    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  39.96 
 
 
2225 aa  659    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  41.9 
 
 
2604 aa  725    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  43.25 
 
 
3099 aa  742    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  42.7 
 
 
3045 aa  724    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  39.4 
 
 
3148 aa  633  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  42.56 
 
 
4111 aa  635  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  39.04 
 
 
3718 aa  635  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  35.51 
 
 
1114 aa  635  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  36.86 
 
 
1658 aa  631  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  39.73 
 
 
1653 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  39.49 
 
 
1646 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  38.44 
 
 
2108 aa  629  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 
1828 aa  624  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>