More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3593 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  100 
 
 
1097 aa  2236    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  37.84 
 
 
956 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.42 
 
 
975 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.99 
 
 
959 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  37.5 
 
 
963 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.22 
 
 
971 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.11 
 
 
971 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  26.14 
 
 
854 aa  188  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  25.82 
 
 
871 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  23.73 
 
 
842 aa  155  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  23.98 
 
 
889 aa  154  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.85 
 
 
887 aa  151  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.58 
 
 
867 aa  124  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  32.43 
 
 
414 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.12 
 
 
840 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.54 
 
 
873 aa  119  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.82 
 
 
826 aa  118  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.99 
 
 
302 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  30.29 
 
 
871 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.03 
 
 
887 aa  115  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  31.75 
 
 
764 aa  114  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.1 
 
 
811 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  29.94 
 
 
758 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.23 
 
 
835 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  34.45 
 
 
906 aa  112  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  31.21 
 
 
971 aa  111  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  29.93 
 
 
275 aa  110  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  31.72 
 
 
788 aa  110  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  28.91 
 
 
842 aa  109  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  28.91 
 
 
842 aa  109  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.22 
 
 
810 aa  108  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  29.35 
 
 
769 aa  108  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  37.08 
 
 
890 aa  108  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  36.71 
 
 
725 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  49.02 
 
 
868 aa  107  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  36.71 
 
 
708 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  49.02 
 
 
868 aa  107  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  49.02 
 
 
868 aa  107  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.72 
 
 
869 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.94 
 
 
797 aa  105  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  31.82 
 
 
366 aa  105  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  27.24 
 
 
788 aa  105  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  47.06 
 
 
868 aa  105  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.97 
 
 
852 aa  105  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  30.86 
 
 
758 aa  104  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  47.12 
 
 
869 aa  103  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  46.73 
 
 
869 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  29.34 
 
 
781 aa  103  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  37.93 
 
 
874 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  47.52 
 
 
868 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  28.85 
 
 
760 aa  102  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  47.12 
 
 
868 aa  103  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
870 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  47.06 
 
 
868 aa  102  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  30.34 
 
 
891 aa  102  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.79 
 
 
868 aa  102  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  47.06 
 
 
868 aa  102  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  31.19 
 
 
758 aa  102  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.36 
 
 
950 aa  102  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  44.66 
 
 
594 aa  101  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  45.63 
 
 
386 aa  101  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  31.6 
 
 
886 aa  101  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  31.06 
 
 
762 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  30.23 
 
 
757 aa  100  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  37.41 
 
 
907 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.27 
 
 
821 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  30.87 
 
 
758 aa  100  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  30.56 
 
 
758 aa  99.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  30.92 
 
 
761 aa  99.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.81 
 
 
891 aa  99.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.02 
 
 
386 aa  99.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  27.78 
 
 
761 aa  99.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  29.57 
 
 
782 aa  98.2  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  30.25 
 
 
758 aa  97.8  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  29.04 
 
 
762 aa  97.8  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  26.5 
 
 
885 aa  98.2  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  30.65 
 
 
758 aa  97.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  24.29 
 
 
865 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  27.85 
 
 
754 aa  97.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  26.5 
 
 
885 aa  97.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.61 
 
 
903 aa  96.3  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.5 
 
 
389 aa  96.3  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.34 
 
 
902 aa  96.3  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2388  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.45 
 
 
812 aa  95.9  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  28.43 
 
 
866 aa  95.9  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.91 
 
 
794 aa  95.9  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 
837 aa  95.9  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  31.88 
 
 
359 aa  95.5  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  29.52 
 
 
825 aa  95.5  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  29.87 
 
 
779 aa  95.5  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  29.18 
 
 
824 aa  95.5  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  41.59 
 
 
609 aa  94.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  28.69 
 
 
892 aa  94.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  27.33 
 
 
791 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.86 
 
 
408 aa  92.8  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  29.55 
 
 
785 aa  92.4  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.12 
 
 
884 aa  92.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  28.06 
 
 
785 aa  91.7  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  32.23 
 
 
799 aa  90.5  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  30.2 
 
 
835 aa  90.9  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>