106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2055 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2055  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 341 aa  687    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24520  predicted xylanase/chitin deacetylase  59.66 
 
 		 292 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0063  hypothetical protein  55.76 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2851  polysaccharide deacetylase  51.21 
 
 		 371 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000258612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  48.5 
 
 		 353 aa  275  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3510  polysaccharide deacetylase  45.56 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2967  hypothetical protein  46.74 
 
 		 363 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0434  polysaccharide deacetylase  34.89 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1341  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000820876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  34.14 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0080  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  22.37 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  24.54 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.61 
 
 		 237 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 598 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  24.07 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 615 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 615 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 253 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 		 219 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 		 627 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  26.1 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  23.75 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  30.57 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 594 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 1001 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  25.84 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.95 
 
 		 349 aa  49.3  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 348 aa  49.3  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  30.71 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 626 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  35.71 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  33.86 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  35.71 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  35.71 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  31.51 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  26.09 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  26.09 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  33.79 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  24.3 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.91 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  25.54 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  25.54 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  35.29 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0362  polysaccharide deacetylase-like protein  29.14 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  29.86 
 
 		 417 aa  43.5  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0315  polysaccharide deacetylase-like protein  29.14 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0330  polysaccharide deacetylase-like protein  29.14 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  24.88 
 
 		 239 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 		 273 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0316  polysaccharide deacetylase-like protein  25.96 
 
 		 367 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0331  polysaccharide deacetylase-like protein  25.96 
 
 		 367 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0363  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 		 367 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  29.58 
 
 		 284 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>