22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0434 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0434  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 382 aa  780    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  39.52 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1341  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000820876  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2055  polysaccharide deacetylase  36.91 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2851  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000258612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0080  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24520  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.59 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2967  hypothetical protein  33.79 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0063  hypothetical protein  35.34 
 
 		 363 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3510  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 		 348 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  24.73 
 
 		 283 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  23.88 
 
 		 306 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  24.61 
 
 		 259 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  23.05 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  25.41 
 
 		 261 aa  44.3  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 278 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>