More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1461 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.47 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  64.44 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.95 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.48 
 
 		 242 aa  279  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.84 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.06 
 
 		 279 aa  269  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6208  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.47 
 
 		 226 aa  268  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  64.71 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  58.93 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5525  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.06 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.997238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1221  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.5 
 
 		 256 aa  254  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.655279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7562  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.86 
 
 		 273 aa  244  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0596  response regulator receiver domain protein  53.57 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.05 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  47.16 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 227 aa  201  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  47.75 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.89 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  46.88 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.44 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  44.54 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  46.64 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 237 aa  192  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  39.19 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  39.19 
 
 		 221 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 239 aa  191  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.4 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 221 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 239 aa  191  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  50.44 
 
 		 265 aa  191  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 231 aa  191  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  45.45 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  45.45 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  47.16 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  47.16 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 		 240 aa  188  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  50 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>