More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0337 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  212  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  88.1 
 
 		 238 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  88.1 
 
 		 238 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  72.97 
 
 		 244 aa  116  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  68.92 
 
 		 243 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 246 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  57.45 
 
 		 245 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  58.11 
 
 		 242 aa  96.7  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  52.17 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  44.93 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  49.28 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  46.38 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  46.97 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  46.38 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  44.78 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 261 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 261 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  47.54 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1966  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 454 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.138243  normal  0.104456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.36 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  47.83 
 
 		 245 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 246 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 241 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0522  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  40.54 
 
 		 242 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  45.71 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 241 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  44.29 
 
 		 244 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1934  transcriptional regulator, GntR family  49.21 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.127514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  40 
 
 		 235 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2287  transcriptional regulator, GntR family  49.21 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 251 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 251 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 246 aa  60.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  44.93 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  44.93 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  45.45 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  44.93 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  44.93 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  44.62 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  45.45 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1824  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4343  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  38.16 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  44.3 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3693  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  40.54 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  43.24 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4376  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2059  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  38.36 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.256407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3559  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  40.54 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  47.69 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 521 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  44.93 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  42.47 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  44.12 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  46.38 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4032  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  40.54 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3696  transcriptional regulator, GntR family protein  44.93 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  43.48 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  47.83 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3954  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  33.98 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  41.1 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>