More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2077 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  100 
 
 		 336 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  39.13 
 
 		 357 aa  215  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  39.65 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  39.46 
 
 		 349 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  37.83 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  41.26 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  36.15 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  37.28 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  34.38 
 
 		 364 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  35.4 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  38.68 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  32.31 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  33.14 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  33.7 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  33.14 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  33.44 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  28.32 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  31.89 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  38.86 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  32.86 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  29.9 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  34.23 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  39.82 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  38.46 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  37.55 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  33.24 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  31.67 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  31.67 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  31.67 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  26.89 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  35.74 
 
 		 398 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  30.84 
 
 		 395 aa  95.9  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  35.81 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 378 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  27.99 
 
 		 343 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  32.37 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  30.54 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  26.7 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  41.73 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.17 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.5 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  38.73 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  36.55 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.86 
 
 		 479 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.81 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  30.07 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  29.65 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.85 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  34.32 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  33.95 
 
 		 554 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.91 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  37.78 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  34.57 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  33.73 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  32.3 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  34.57 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  27.39 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  26.14 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  26.14 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  31.51 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.57 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  30.05 
 
 		 589 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  30.6 
 
 		 588 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  30.6 
 
 		 564 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  30.6 
 
 		 588 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  24.88 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  31.87 
 
 		 590 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 		 569 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  30.04 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  30.6 
 
 		 588 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 		 521 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  31.76 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  29.51 
 
 		 589 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  29.51 
 
 		 560 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  29.63 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  29.51 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  29.51 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  29.51 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  29.51 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  30.05 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  29.51 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  30.05 
 
 		 564 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  26.46 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  31.52 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  27.56 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  31.32 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  29.51 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.3 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>