145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1044 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  721    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0838  putative permease, YjgP/YjgQ family protein  26.26 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0265755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.16 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 360 aa  92.4  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  19.32 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  25.07 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.55 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.69 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  23.08 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.59 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  21.25 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 		 1061 aa  79.3  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 		 1040 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  22.04 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  21.19 
 
 		 1061 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  20.75 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.56 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.28 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.59 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  19.94 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  21.63 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  18.52 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  20.06 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  19.44 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20.33 
 
 		 1153 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  19.38 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  19.49 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.64 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  20.6 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.07 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  21.67 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  20.27 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  20.68 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.96 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  20.05 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  30.33 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  26.94 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  19.17 
 
 		 1096 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.54 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  20.33 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  20.73 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  20.34 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  30.43 
 
 		 442 aa  57  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.6 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  30.5 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  20.47 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  20.17 
 
 		 1111 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  19.78 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  30.58 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.4 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  20.43 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 364 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  27.82 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  19.78 
 
 		 360 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  20.66 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2345  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 346 aa  53.1  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.06 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  18.85 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  20.41 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  21.56 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  30.08 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  21.47 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  31.78 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  29.52 
 
 		 441 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  20.66 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  20.06 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.97 
 
 		 400 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  18.11 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  29.51 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  29.51 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  22.34 
 
 		 359 aa  49.7  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  21.49 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 478 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  20.62 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>