More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1104 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  100 
 
 		 421 aa  819    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  57.45 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  57.45 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  58.94 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  52.61 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  56.68 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  56.2 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  54.14 
 
 		 437 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  52.86 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  51.04 
 
 		 412 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  51.47 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  46.52 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17001  cell division membrane protein  49.01 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.746049 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  46.02 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  45.22 
 
 		 422 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  43.66 
 
 		 423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  43.42 
 
 		 422 aa  329  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  42.86 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  42.98 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  39.95 
 
 		 378 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  43.69 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  41.78 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.45 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.09 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  37.88 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.67 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  38.35 
 
 		 366 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  39.27 
 
 		 377 aa  219  8.999999999999998e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  33.57 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  34.82 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  37.88 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  37.88 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.67 
 
 		 371 aa  213  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  35.97 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.86 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  36.87 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.61 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  35.61 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  39.68 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 		 369 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  35.94 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  34.64 
 
 		 378 aa  206  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  33.94 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  33.09 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  35.29 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  37.02 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  37.01 
 
 		 366 aa  203  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  33.17 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  31.7 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  36.68 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  36.13 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  34.65 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  35.59 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  37.04 
 
 		 408 aa  200  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  37.97 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  34.34 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  35.24 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0292  cell cycle protein  37.99 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  33.01 
 
 		 433 aa  196  6e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  36.59 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  34.98 
 
 		 413 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  34.47 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1604  rod shape-determining protein RodA  36.75 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  33.59 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  39.18 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 		 376 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  33.09 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  35.36 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  35.86 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  35.36 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  30.43 
 
 		 367 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  35.86 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  37.92 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  37.65 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  34.27 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  35.61 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  35.63 
 
 		 366 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1106  cell cycle protein  34.29 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.860681  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  31.15 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  36.08 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  33.51 
 
 		 368 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  34.42 
 
 		 389 aa  190  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  36.71 
 
 		 382 aa  190  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1526  cell cycle protein  35.32 
 
 		 379 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  34.2 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  35.42 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  33.98 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  33.5 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  33.63 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.92 
 
 		 367 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 		 384 aa  186  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  30.89 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  35.92 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  33.74 
 
 		 368 aa  186  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>