More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1526 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1526  cell cycle protein  100 
 
 		 379 aa  739    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  45.3 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.73 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  41.67 
 
 		 367 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  40.59 
 
 		 380 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  36.07 
 
 		 421 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  40.46 
 
 		 382 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  42.14 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  38.48 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  37.71 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  37.71 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  44.17 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  46.67 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  44.35 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  38.39 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  36.93 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  39.22 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  38.29 
 
 		 371 aa  222  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  42.13 
 
 		 413 aa  222  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  42.42 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  37.13 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  40.56 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35.98 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  37.13 
 
 		 422 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  36.56 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  37.27 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  40.11 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  42.49 
 
 		 412 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  37.5 
 
 		 438 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  38.97 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  38.97 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  40.17 
 
 		 363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  37.53 
 
 		 422 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  38.26 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  39.47 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  38.44 
 
 		 423 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  37.57 
 
 		 367 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  39.14 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  40.41 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  40.87 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  35.98 
 
 		 361 aa  205  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  39.28 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  37.61 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  39.84 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  40.88 
 
 		 411 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.84 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 373 aa  202  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  38.11 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  38.11 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  41.76 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  39.01 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  36.07 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  38.36 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.57 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  45.05 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 366 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  37.14 
 
 		 368 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  39.31 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  35.9 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  39.55 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  36.89 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  40.62 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  36.19 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  36.16 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  38.89 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  36.19 
 
 		 424 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.87 
 
 		 367 aa  195  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  37.28 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  32.42 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  37.54 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  37.53 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.87 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.87 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  37.63 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2368  cell cycle protein  34.76 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0217329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4040  cell cycle protein  36.56 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  38.86 
 
 		 373 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  38.35 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  39.04 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  35.65 
 
 		 403 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  39.02 
 
 		 380 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  38.8 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  38.97 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.64 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  40.32 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>