More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1634 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 378 aa  744    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  46.84 
 
 		 380 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  47.23 
 
 		 378 aa  355  8.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  47.12 
 
 		 387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  44.09 
 
 		 377 aa  315  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  45.14 
 
 		 388 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  45.76 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.85 
 
 		 365 aa  280  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  42.86 
 
 		 379 aa  276  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  39.07 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.8 
 
 		 372 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  39.19 
 
 		 419 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  40.65 
 
 		 426 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  38.85 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  38.28 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  38.69 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  36.58 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  38.54 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  36.09 
 
 		 421 aa  229  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  37.93 
 
 		 388 aa  229  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  37.96 
 
 		 390 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  39.06 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  36.76 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  39.63 
 
 		 401 aa  226  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  38.15 
 
 		 411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  37.22 
 
 		 369 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  37.63 
 
 		 386 aa  222  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  39.08 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  36.58 
 
 		 413 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  38.07 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  36.8 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  38.51 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  38.17 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  41.08 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  35.7 
 
 		 408 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  36.01 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  39.2 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  38.19 
 
 		 366 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  38.94 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  37.84 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  38.67 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  37.63 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 		 366 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  34.83 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  34.5 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  34.5 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  36.06 
 
 		 423 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  35.12 
 
 		 380 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  36.1 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  37.7 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  37.36 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  38.01 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  37.57 
 
 		 412 aa  203  5e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  35.88 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  35.42 
 
 		 370 aa  202  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  36.47 
 
 		 380 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  34.76 
 
 		 374 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0063  rod shape-determining (RODA protein) transmembrane  35.48 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913941  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  40.8 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  35.15 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  35.39 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  34.34 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  36.8 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  35.39 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  35.6 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  34.85 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  34.85 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  34.64 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  35.12 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  37.78 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  38.99 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0048  rod shape-determining protein RodA  35.83 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  38.64 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0362  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  38 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  33.17 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  38 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  38.32 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  35.12 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  36.19 
 
 		 368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  36.29 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  37.74 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0142  rod shape-determining protein RodA  35.9 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>