More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7278 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  100 
 
 		 387 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  65.61 
 
 		 386 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  59.36 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  50.53 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  48.9 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  49.86 
 
 		 413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  48.21 
 
 		 411 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  47.13 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  49.18 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  49.31 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  41.4 
 
 		 365 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  45.12 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  39.22 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11520  rod shape-determining protein RodA  44.38 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0049464  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  40.6 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  37.99 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  36.17 
 
 		 379 aa  225  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.08 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  36.84 
 
 		 369 aa  222  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  36.31 
 
 		 376 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  40.53 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 		 398 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  38.78 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35.47 
 
 		 417 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  36.66 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  40.48 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  35.11 
 
 		 371 aa  216  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  36.23 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  36.23 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 403 aa  209  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 364 aa  209  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  35.41 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  36.02 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.97 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  37.63 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  39.06 
 
 		 376 aa  202  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  33.92 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  37.3 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  37.67 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  35.97 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  37.35 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.87 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.32 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  37.5 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  38.7 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  36.94 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  37.99 
 
 		 380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  34.79 
 
 		 371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  36.62 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000981  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  33.51 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  36.51 
 
 		 365 aa  196  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  34.37 
 
 		 360 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  33.07 
 
 		 372 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  33.83 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  39.17 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  35.29 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  36.74 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.29 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  36.76 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  32.03 
 
 		 408 aa  193  4e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  36.96 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  38.17 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4083  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  34.2 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.66 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  33.33 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  36.86 
 
 		 374 aa  192  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.42 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  34.24 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  34.13 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0779  cell cycle protein  34.38 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  37.8 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  33.86 
 
 		 370 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  31.25 
 
 		 421 aa  190  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  39.73 
 
 		 420 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1691  cell cycle protein FtsW  31.65 
 
 		 403 aa  189  9e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.951767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  37.65 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  37.65 
 
 		 367 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 367 aa  189  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1325  cell cycle protein FtsW  33.68 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  34.33 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  37.99 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4806  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  0.152125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  35.47 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4681  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2121  cell cycle protein  32.83 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0218982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2159  cell cycle protein  32.83 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 372 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  40.65 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  34.38 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  34.38 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>