More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14200 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  100 
 
 		 405 aa  817    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  63.32 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  58.65 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  42.08 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.58 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.6 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  37.43 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  35.26 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  33.42 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  36.8 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35.14 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  35 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  38.11 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  37.68 
 
 		 368 aa  203  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  40.28 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  36.64 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  36.84 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  34.57 
 
 		 412 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  31.73 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  35.08 
 
 		 363 aa  200  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 		 426 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 378 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.93 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  38.15 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  36.61 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  33.5 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.07 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  34.96 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  33.5 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  33.84 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  32.47 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  34.05 
 
 		 412 aa  192  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  33.89 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  33.89 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  33.89 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  37.76 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  36.08 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  31.5 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  37.13 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  36.02 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.73 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  40.18 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  37.84 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  33.09 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  34.33 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  33.51 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  35.89 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  33.59 
 
 		 407 aa  187  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  34.33 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  32.35 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 368 aa  186  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  35.5 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  30.35 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  31.1 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  34.98 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  34.28 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  32.45 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  32.17 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  32.17 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  32.65 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  31.9 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  38.12 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  32.67 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  34.4 
 
 		 509 aa  183  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  33 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  31.96 
 
 		 368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  31.96 
 
 		 368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  31.96 
 
 		 368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  34.94 
 
 		 381 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  31.96 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  35.65 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  32.97 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 366 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  33.88 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  35.51 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  34.81 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  36.08 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  36.18 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  33.33 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  34.75 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  32.96 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  33.88 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  35.77 
 
 		 370 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  36 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  31.03 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0779  cell cycle protein  35.07 
 
 		 390 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>