More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3056 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 
419 aa  828    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  76.87 
 
 
417 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  76.87 
 
 
417 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  59.73 
 
 
438 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  59.06 
 
 
426 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  59.5 
 
 
437 aa  500  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  59.35 
 
 
417 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  58.94 
 
 
421 aa  450  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  48.86 
 
 
412 aa  353  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  48.24 
 
 
412 aa  347  3e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  47.12 
 
 
427 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  40.87 
 
 
422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  42.37 
 
 
423 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  43.81 
 
 
424 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  42.68 
 
 
424 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  40.43 
 
 
422 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  41.58 
 
 
422 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17001  cell division membrane protein  48.8 
 
 
426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.746049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  40.19 
 
 
380 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  45.48 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  36.07 
 
 
365 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  41.89 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.7 
 
 
379 aa  233  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.52 
 
 
373 aa  233  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  39.19 
 
 
378 aa  232  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  43.08 
 
 
412 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  39.95 
 
 
387 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  41.3 
 
 
388 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  39.78 
 
 
398 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  33.93 
 
 
374 aa  223  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  40.06 
 
 
387 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  36.16 
 
 
379 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  37.62 
 
 
407 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 
371 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  36.25 
 
 
390 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  34.91 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  33.66 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  33.74 
 
 
376 aa  216  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.09 
 
 
366 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  37.2 
 
 
376 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  37.03 
 
 
404 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  35.26 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  35.14 
 
 
379 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  35.14 
 
 
379 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  36.08 
 
 
371 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  33.65 
 
 
369 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  33.92 
 
 
371 aa  210  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  36.04 
 
 
357 aa  210  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  36.2 
 
 
369 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  35.53 
 
 
374 aa  206  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  35.24 
 
 
408 aa  206  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.84 
 
 
367 aa  206  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  36.03 
 
 
408 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  33.67 
 
 
366 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  35.47 
 
 
380 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.59 
 
 
367 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.59 
 
 
367 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 
401 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  36.8 
 
 
411 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 
372 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  36.77 
 
 
382 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  34.71 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  35.37 
 
 
372 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  34.32 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 
368 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  33.86 
 
 
384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.09 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  37.12 
 
 
407 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  33.5 
 
 
366 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  37.88 
 
 
418 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  32.59 
 
 
384 aa  199  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 
371 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  34.35 
 
 
386 aa  199  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.96 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  33.99 
 
 
389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  37.56 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  33.1 
 
 
427 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  34.24 
 
 
365 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 
368 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  34.53 
 
 
403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  34.53 
 
 
364 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  33.97 
 
 
382 aa  196  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  34.13 
 
 
433 aa  196  8.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  33.67 
 
 
385 aa  196  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1604  rod shape-determining protein RodA  35.51 
 
 
379 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287135  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 
421 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 
368 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  32.52 
 
 
388 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  34.66 
 
 
412 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  34.46 
 
 
368 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 
366 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 
421 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.901806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>