More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2588 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 371 aa  741    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  47.83 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  47.55 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  46.47 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  47.55 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  47.28 
 
 		 366 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  46.47 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  44.84 
 
 		 366 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  45.65 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  43.75 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  43.75 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  44.09 
 
 		 371 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.27 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  45.58 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  43.16 
 
 		 369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  44.2 
 
 		 371 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  43.75 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  44.41 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  43.75 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  43.51 
 
 		 373 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  40.44 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  40.97 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  44.89 
 
 		 371 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  40.64 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  40.56 
 
 		 373 aa  259  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  41.26 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  40.27 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  41.45 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  38.61 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  39.02 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  42.19 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  42.29 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  38.04 
 
 		 371 aa  250  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 367 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 367 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  41.13 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 368 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  42.14 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  39.06 
 
 		 368 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  41.33 
 
 		 374 aa  245  8e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  42.54 
 
 		 370 aa  245  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  39.55 
 
 		 374 aa  245  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.77 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  39.45 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  39.83 
 
 		 368 aa  242  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 		 372 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.43 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  38.15 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  38.85 
 
 		 384 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  38.26 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  40.94 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  38.61 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  38.5 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  39.71 
 
 		 383 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  41.16 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  39.13 
 
 		 366 aa  236  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  40.94 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 373 aa  235  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  44.67 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  39.83 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  42.73 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  42.19 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  39.78 
 
 		 377 aa  234  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  42.28 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  40.23 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  39.72 
 
 		 385 aa  232  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  39.25 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  40.05 
 
 		 373 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  39.5 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 376 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  38.26 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  38.2 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  44.98 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  43.92 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.6 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  39.73 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  35.42 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  39.5 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  38.08 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  38.3 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  38.59 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1091  rod shape-determining protein RodA  37.92 
 
 		 384 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  38.3 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  37.74 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  41.9 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  42.41 
 
 		 381 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  37.67 
 
 		 380 aa  225  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  44.1 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  36.96 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  42.41 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  36.64 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  42.33 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  42.28 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>