More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3647 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  85.34 
 
 		 389 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  90.31 
 
 		 386 aa  680    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 390 aa  771    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 390 aa  771    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  78.95 
 
 		 384 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1091  rod shape-determining protein RodA  79.74 
 
 		 384 aa  594  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0941  rod shape-determining protein RodA  78.39 
 
 		 384 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  73.42 
 
 		 384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2191  rod shape-determining protein RodA  79.53 
 
 		 421 aa  567  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  69.39 
 
 		 384 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  69.03 
 
 		 385 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  62.67 
 
 		 380 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0063  rod shape-determining (RODA protein) transmembrane  62.93 
 
 		 380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913941  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  61.66 
 
 		 380 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  61.44 
 
 		 382 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  60.64 
 
 		 382 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3363  rod shape-determining protein RodA  62.4 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3686  rod shape-determining protein RodA  62.67 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  60.11 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  60.37 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  60.37 
 
 		 382 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  59.57 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  59.57 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  59.57 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  60.9 
 
 		 382 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  60.9 
 
 		 382 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  60.9 
 
 		 382 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  60.9 
 
 		 382 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  60.9 
 
 		 382 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0142  rod shape-determining protein RodA  60.64 
 
 		 382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  60.9 
 
 		 382 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0362  rod shape-determining protein RodA  60.64 
 
 		 382 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  60.64 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0048  rod shape-determining protein RodA  60.53 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1742  rod shape-determining protein RodA  59.33 
 
 		 383 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2025  rod shape-determining protein RodA  58.86 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0161321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0240  rod shape-determining protein RodA  66.14 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  57.22 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  54.52 
 
 		 366 aa  335  5.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  51.85 
 
 		 366 aa  335  7e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  49.32 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  48.54 
 
 		 368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  46.81 
 
 		 368 aa  323  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  48.8 
 
 		 367 aa  322  8e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  48.8 
 
 		 367 aa  322  8e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  50.28 
 
 		 367 aa  322  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  48.27 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  48.27 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  48.27 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  48.27 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  47.34 
 
 		 368 aa  316  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  48.8 
 
 		 372 aa  316  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  47.89 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  46.84 
 
 		 368 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  45.89 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  44.01 
 
 		 372 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  46.53 
 
 		 368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  47.89 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  47.08 
 
 		 371 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  44.66 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  48.25 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  44.6 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  47.65 
 
 		 373 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  48.52 
 
 		 402 aa  295  7e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  48.09 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  44.84 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  44.84 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  45.45 
 
 		 383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  47.55 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  46.2 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  48.46 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  50.96 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  47.47 
 
 		 373 aa  279  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  51.59 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  45.28 
 
 		 376 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  47.47 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  46.91 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  51.92 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  51.91 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  52.24 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  45.63 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  47.66 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  45.92 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  46.63 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  50.32 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  46.4 
 
 		 380 aa  268  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  51.12 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  48.97 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  49.26 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  50.8 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  47.21 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  50.8 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  50.8 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  47.21 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  50.8 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  50.8 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  47.21 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  50.8 
 
 		 370 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  51.12 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  51.12 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>