More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2483 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 382 aa  756    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  54.85 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  52.01 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  52.49 
 
 		 379 aa  363  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  52.63 
 
 		 379 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  52.63 
 
 		 379 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  48.06 
 
 		 386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  50 
 
 		 380 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  52.67 
 
 		 385 aa  345  6e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  51.25 
 
 		 384 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  50.28 
 
 		 379 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  51.03 
 
 		 376 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1604  rod shape-determining protein RodA  52.76 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  48.16 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  48.34 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  47.71 
 
 		 371 aa  311  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  43.44 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  48.02 
 
 		 368 aa  305  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  46.03 
 
 		 373 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  44.85 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  50.46 
 
 		 368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  46.74 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  48.97 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  43.17 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  47.41 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  49.14 
 
 		 370 aa  299  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  48.93 
 
 		 372 aa  298  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  49.7 
 
 		 380 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  48 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  48 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  48 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  45.98 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  47.67 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  48.96 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  50.47 
 
 		 372 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  48.28 
 
 		 368 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  48.68 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  48.66 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  47.79 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  47.79 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  47.79 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  47.79 
 
 		 368 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  47.28 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  45.17 
 
 		 374 aa  295  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  47.53 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  48.15 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  47.55 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  47.48 
 
 		 368 aa  292  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  44.66 
 
 		 366 aa  292  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  48.97 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  47.7 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  46.42 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  44.04 
 
 		 366 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  44.82 
 
 		 366 aa  289  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  46.09 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  47.99 
 
 		 370 aa  289  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  48.82 
 
 		 380 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  47.46 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  48.22 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  43.41 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  50.94 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4806  rod shape-determining protein RodA  48.36 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  0.152125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  50.62 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  50.94 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  50.94 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4681  rod shape-determining protein RodA  48.36 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  50.94 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  50.94 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  50.94 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  50.94 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  50.94 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  47.7 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  44.54 
 
 		 366 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  50.62 
 
 		 370 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  43.73 
 
 		 382 aa  285  7e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  50 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  50 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  50 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  50 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  50 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  46.88 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  44.57 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  45.79 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  46.06 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  49.84 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  47.41 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  47.34 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  47.63 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  47.41 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  47.41 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  49.04 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  45.5 
 
 		 373 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  43.05 
 
 		 389 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2132  rod shape-determining protein RodA  48.12 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  42.78 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  42.6 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  46.04 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  48.44 
 
 		 370 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  43.17 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  42.7 
 
 		 370 aa  273  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>