More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0103 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 374 aa  739    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  42.57 
 
 		 371 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  40.12 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  37.9 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  41.37 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  41.3 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  39.35 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  40.65 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  40.24 
 
 		 374 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  42.6 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  40.58 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  41.3 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  41.61 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  41.52 
 
 		 366 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  39.71 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  40 
 
 		 370 aa  230  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  36.75 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  35.46 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  38.44 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  39.4 
 
 		 379 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  40.42 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  33.93 
 
 		 419 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  36.11 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  41.77 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  39.36 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  39.81 
 
 		 373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  37.01 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  43.61 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  39.82 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  39.59 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 417 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  39.59 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  39.59 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  41.42 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  39.59 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 417 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  39.59 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  39.82 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  39.82 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  39.82 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  42.71 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  42.2 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  39.82 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  39.82 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  39.82 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  39.82 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  41.74 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  39.03 
 
 		 370 aa  223  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35.61 
 
 		 417 aa  222  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  40.65 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  41.12 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  41.99 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  38.36 
 
 		 371 aa  222  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  39.66 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  38.92 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  37.91 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  40.71 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  40.31 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  39.2 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  38.65 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  41.51 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  43.33 
 
 		 368 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  40.33 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  43.27 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  43.27 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  42.96 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  40 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  39.78 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  40.58 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  40.58 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  40.76 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  40.58 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  37.82 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  41.69 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  38.98 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  44.8 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1106  cell cycle protein  37.18 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.860681  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  41.59 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  35.16 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0236  cell wall shape-determining protein  44.44 
 
 		 363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  37.36 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  33.62 
 
 		 364 aa  212  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  36.31 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  35.16 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>