More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1455 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  99.73 
 
 
373 aa  740    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  99.2 
 
 
373 aa  738    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 
373 aa  741    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  84.45 
 
 
373 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  51.91 
 
 
365 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  47.96 
 
 
366 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  50 
 
 
366 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  46.3 
 
 
366 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  48.91 
 
 
366 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  46.98 
 
 
366 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  45.75 
 
 
366 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  45.9 
 
 
366 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  43.75 
 
 
371 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  47.77 
 
 
368 aa  276  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  46.32 
 
 
384 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  38.67 
 
 
365 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  42.21 
 
 
386 aa  252  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  41.95 
 
 
371 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  40.38 
 
 
368 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  40.28 
 
 
363 aa  246  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  40.85 
 
 
382 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  41.35 
 
 
371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  38.4 
 
 
379 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  42.35 
 
 
374 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  47.74 
 
 
371 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  44.21 
 
 
366 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.93 
 
 
380 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  42.41 
 
 
372 aa  235  9e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  40.76 
 
 
384 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  39.62 
 
 
382 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  38.33 
 
 
379 aa  233  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  40.17 
 
 
379 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  40.17 
 
 
379 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  40.97 
 
 
382 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  40.97 
 
 
382 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  40.97 
 
 
382 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  40.81 
 
 
373 aa  232  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  40.97 
 
 
382 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  41.19 
 
 
368 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 
367 aa  231  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  40.22 
 
 
370 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  40.43 
 
 
382 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  41.81 
 
 
373 aa  230  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  38.59 
 
 
366 aa  229  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  36.36 
 
 
379 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  38.64 
 
 
382 aa  229  7e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  42.39 
 
 
403 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  39.35 
 
 
382 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 
368 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  44.01 
 
 
364 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  39.26 
 
 
368 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  37.39 
 
 
372 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 
382 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  41.92 
 
 
372 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  40.37 
 
 
373 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  37.6 
 
 
376 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  40.16 
 
 
380 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  38.59 
 
 
371 aa  226  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  44.53 
 
 
366 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  38.35 
 
 
362 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  40.75 
 
 
368 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.79 
 
 
369 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  39.66 
 
 
366 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  40.33 
 
 
371 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  47.28 
 
 
366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  37.84 
 
 
368 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 
380 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  41.46 
 
 
380 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 
372 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  38.73 
 
 
371 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  37.2 
 
 
367 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  41.51 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  41.5 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  41.18 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  41.51 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  41.83 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  41.51 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  37.87 
 
 
388 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.07 
 
 
378 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  40.57 
 
 
402 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  41.9 
 
 
370 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 
382 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0362  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 
382 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  38.84 
 
 
373 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1742  rod shape-determining protein RodA  38.93 
 
 
383 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 
382 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  38.06 
 
 
373 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 
382 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 
382 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 
382 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 
382 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0063  rod shape-determining (RODA protein) transmembrane  39.47 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913941  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0142  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  40.97 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  36.89 
 
 
385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0048  rod shape-determining protein RodA  39.35 
 
 
382 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>