More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2544 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 366 aa  736    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  77.05 
 
 		 366 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  68.03 
 
 		 366 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  68.58 
 
 		 366 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  68.03 
 
 		 366 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  67.21 
 
 		 366 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  68.03 
 
 		 366 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  60.93 
 
 		 365 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  46.47 
 
 		 371 aa  325  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  47.96 
 
 		 373 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  47.96 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  46.89 
 
 		 368 aa  308  9e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  46.49 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  46.76 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  47.68 
 
 		 373 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  47.43 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  42.15 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  45.28 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  43.9 
 
 		 368 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  44.17 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  42.4 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  43.82 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  45.28 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  43.17 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  43.25 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  42.11 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  39.52 
 
 		 378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  50.7 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  45.17 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  46.6 
 
 		 368 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  42.11 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  46.6 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  44.15 
 
 		 376 aa  259  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  40.11 
 
 		 386 aa  259  7e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  44.88 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  42.01 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  44.6 
 
 		 368 aa  256  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  43.57 
 
 		 368 aa  255  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  45.13 
 
 		 366 aa  255  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  42.05 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  43.86 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  43.86 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  44.55 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  41.99 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  42.9 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  41.41 
 
 		 373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  39.52 
 
 		 377 aa  252  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  42.46 
 
 		 372 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  42.46 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  42.46 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  42.46 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  42.46 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  47.83 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  41.73 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  39.47 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  44.51 
 
 		 373 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  42.19 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  37.09 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  41.76 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  41.69 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  43.61 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  42.28 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  38.95 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  45.38 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  41.42 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  46.1 
 
 		 380 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  44.65 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  44.16 
 
 		 370 aa  242  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 403 aa  242  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  39.32 
 
 		 387 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  42.55 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  40.48 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  36.09 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  39.06 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  39.95 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  45.95 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  40.48 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  42.99 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  39.95 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  41.4 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  40.73 
 
 		 366 aa  239  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  41.81 
 
 		 376 aa  238  8e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  39.95 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  41.46 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  46.2 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  46.2 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  46.2 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  46.2 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  46.2 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  39.41 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  46.2 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  44.14 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  37.54 
 
 		 369 aa  235  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  46.2 
 
 		 370 aa  236  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>