More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0929 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 366 aa  736    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  74.86 
 
 		 366 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  74.32 
 
 		 366 aa  552  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  72.13 
 
 		 366 aa  524  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  70.77 
 
 		 366 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  68.58 
 
 		 366 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  67.76 
 
 		 366 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  58.47 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  50.42 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  44.84 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  46.98 
 
 		 373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  46.98 
 
 		 373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  46.47 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  45.21 
 
 		 380 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  44.59 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  45.16 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  43.29 
 
 		 365 aa  299  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  47.53 
 
 		 373 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  46.9 
 
 		 373 aa  295  8e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  45.8 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  44.66 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  44.57 
 
 		 371 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  41.22 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  45.48 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  43.99 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  39.83 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  39.47 
 
 		 412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  42.35 
 
 		 373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  48.72 
 
 		 371 aa  265  8.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  41.67 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  43.61 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  42.43 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  42.66 
 
 		 366 aa  261  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  39.61 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  41.34 
 
 		 367 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  41.34 
 
 		 367 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  41.18 
 
 		 367 aa  259  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  39.61 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  42.58 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  41.27 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  42.94 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  43.17 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  44.73 
 
 		 376 aa  255  7e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  47.2 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  41.87 
 
 		 368 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  46.5 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  41.81 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  41.81 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  41.81 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  42.94 
 
 		 362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  46.5 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  44.19 
 
 		 368 aa  252  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  39.17 
 
 		 372 aa  252  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  42.82 
 
 		 377 aa  252  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  42.9 
 
 		 373 aa  249  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  41.98 
 
 		 368 aa  249  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  43.54 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  41.57 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  41.67 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  39.45 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  40.59 
 
 		 388 aa  246  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  36.77 
 
 		 369 aa  245  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  40.71 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  39.07 
 
 		 371 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  41.44 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  45.54 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  46.67 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  39.5 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.23 
 
 		 379 aa  242  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  42.68 
 
 		 370 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  41.6 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  45.28 
 
 		 380 aa  240  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  42.06 
 
 		 373 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  42.68 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  43.29 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  46.55 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  45.61 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  40.53 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  41.71 
 
 		 370 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  48 
 
 		 380 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  41.94 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  37.74 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  40.33 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  44.01 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  46.91 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  39.57 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  47.27 
 
 		 381 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  42.32 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  42.32 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  42.9 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  42.32 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  42.32 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  42.32 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  42.32 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  42.32 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  37.01 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  47.18 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  39.04 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>