More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5928 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 378 aa  754    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  41.78 
 
 		 366 aa  259  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  41.73 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  41.73 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  41.16 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  41.16 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  39.52 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  41.13 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  38.52 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  39.57 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  39.28 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  39.62 
 
 		 368 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  34.07 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  41.42 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  39.02 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  40.71 
 
 		 366 aa  235  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  39.35 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  36.11 
 
 		 374 aa  230  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  34.92 
 
 		 379 aa  229  9e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  39.56 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  38.24 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  39.5 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  37.98 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  37.87 
 
 		 385 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.33 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  38.53 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  39.15 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  40.78 
 
 		 370 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  38.03 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  39.95 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  39.61 
 
 		 370 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  38.03 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  37.5 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  37.89 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  37.89 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  37.89 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  35.6 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.7 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  35.6 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  36.68 
 
 		 380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  38.01 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  37.63 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  37.54 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  38.59 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  37.37 
 
 		 382 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  35.18 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  38.32 
 
 		 384 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  38.21 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  35.18 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  40.22 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  40.22 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  40.22 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  38.8 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  37.19 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  35.91 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  33.9 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  34.31 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  36.69 
 
 		 387 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  37.89 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  34.82 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  36.89 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  36.91 
 
 		 384 aa  206  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0048  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  36.07 
 
 		 380 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.79 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0362  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  46.89 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0063  rod shape-determining (RODA protein) transmembrane  36.89 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913941  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  46.52 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  46.52 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  46.52 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  34.18 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  46.52 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  46.52 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0142  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099283  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  46.89 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  46.15 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  36.09 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  46.89 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  46.89 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  46.89 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>