More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0579 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 384 aa  761    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  60.76 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  51.37 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  47.93 
 
 		 379 aa  327  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  48.28 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  48.28 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  50.76 
 
 		 376 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  47.66 
 
 		 379 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1604  rod shape-determining protein RodA  48.81 
 
 		 379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  44.6 
 
 		 380 aa  302  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  44.8 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  44.41 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  45.11 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  45.11 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  44.03 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  43.33 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  45.21 
 
 		 368 aa  272  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  41.67 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  44.91 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  43.27 
 
 		 367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  43.47 
 
 		 367 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  43.47 
 
 		 367 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  41.64 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  43.73 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  43.73 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  43.73 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  43.73 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  44.31 
 
 		 368 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  43.44 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  42.62 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  39.94 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  41.64 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  42.44 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  42.39 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  42.63 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  43.14 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  42.14 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  42.06 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  43.62 
 
 		 368 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  39.9 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  42.94 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  42.34 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  41.25 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  42.39 
 
 		 371 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  41.96 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  43.44 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  41.34 
 
 		 370 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  40.76 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  42.06 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  42.48 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  40.76 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  40.81 
 
 		 364 aa  244  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  41.34 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  41.62 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  44.04 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  41.62 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  42.41 
 
 		 376 aa  242  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  40.43 
 
 		 377 aa  242  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 366 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  39.41 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  42.36 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  43.73 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  43.15 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  40.45 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  41.11 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  40.49 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  40.33 
 
 		 370 aa  236  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  39.72 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  42.69 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  40.37 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  39.23 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  38.59 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  42.2 
 
 		 370 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  42.66 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  39.62 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  42.45 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  41.67 
 
 		 382 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  42.45 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  39.32 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  41.11 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  41.11 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  41.11 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  41.19 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>