More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0659 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 386 aa  775    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  60.76 
 
 		 384 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  48.06 
 
 		 382 aa  338  8e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  47.61 
 
 		 379 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  48.34 
 
 		 379 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  48.34 
 
 		 379 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  46.69 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  49.85 
 
 		 376 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  46.26 
 
 		 380 aa  315  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1604  rod shape-determining protein RodA  48.62 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  45.21 
 
 		 385 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  45.43 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  42.13 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  48.77 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  42.62 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  42.62 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  42.06 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  44.72 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  42.06 
 
 		 368 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  42.05 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  48.9 
 
 		 364 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  39.95 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  40.74 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  40.74 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  40.74 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  43.36 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  43.18 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  41.48 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  43.02 
 
 		 373 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  43.47 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  42.77 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  40.05 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  40.05 
 
 		 372 aa  259  7e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  44.38 
 
 		 383 aa  259  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  42.77 
 
 		 368 aa  258  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  38.98 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  41.36 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  43.13 
 
 		 402 aa  252  7e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  45.56 
 
 		 366 aa  252  8.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  42.13 
 
 		 365 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  44.48 
 
 		 376 aa  252  9.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  45.82 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  41.08 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  40.11 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  40.44 
 
 		 376 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  41.79 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  40.92 
 
 		 368 aa  249  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  42.69 
 
 		 372 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  45.42 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  41.03 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  41.74 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  37.64 
 
 		 367 aa  245  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  39.61 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  42.21 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  41.37 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  42.21 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  42.73 
 
 		 361 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  41.21 
 
 		 377 aa  242  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 373 aa  242  9e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  42.72 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  40.69 
 
 		 370 aa  238  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  40.97 
 
 		 370 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  40.97 
 
 		 370 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  41.81 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  41.81 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  41.81 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  42.32 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  41.04 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  41.81 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  41.04 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  41.81 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  41.81 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  41.04 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  41.04 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  41.04 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  41.81 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  41.04 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  42.32 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  39.61 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  39 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  41.12 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  42.66 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  39.39 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  40.5 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  41.47 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  40.22 
 
 		 384 aa  235  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  41.93 
 
 		 373 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  41.04 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  39.12 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  39.84 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  41.23 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  38.23 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  41.83 
 
 		 373 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  41.64 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  43.58 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>