More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2013 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 385 aa  753    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  52.67 
 
 		 382 aa  342  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  46.49 
 
 		 379 aa  319  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  47.43 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  46.77 
 
 		 379 aa  305  9.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  44.62 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  44.62 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  44.72 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  45.19 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  44.17 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  42.18 
 
 		 384 aa  272  7e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  43.31 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1604  rod shape-determining protein RodA  44.89 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  43.92 
 
 		 371 aa  262  8e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  40.79 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  41.35 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  46.01 
 
 		 370 aa  259  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  43.87 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  45.32 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  45.32 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  42.25 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  43.88 
 
 		 376 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  41.31 
 
 		 368 aa  255  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  45.4 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  45.96 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  45.96 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  45.96 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  41.03 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  41.11 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  40.79 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  43.6 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  43.01 
 
 		 376 aa  249  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  40.82 
 
 		 368 aa  249  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  43.97 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  41.21 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  41.23 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  46.27 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  45.65 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  44.72 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  46.27 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  42.35 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  44.17 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 		 367 aa  245  9e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  41.59 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  39.73 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  40.77 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  40.77 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  40.35 
 
 		 368 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  40.35 
 
 		 368 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  40.35 
 
 		 368 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  40.35 
 
 		 368 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  41.54 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  41.59 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  41.42 
 
 		 381 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  41.3 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  41.71 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  40.29 
 
 		 383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  41.11 
 
 		 376 aa  236  7e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  41.95 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  42.9 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  42.24 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  37.6 
 
 		 372 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  41.54 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  41.83 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  42.29 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  39.84 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4806  rod shape-determining protein RodA  42.61 
 
 		 374 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  0.152125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4681  rod shape-determining protein RodA  42.61 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  40.75 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  37.99 
 
 		 380 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  41.36 
 
 		 372 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  41.54 
 
 		 362 aa  229  9e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  38.22 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  42.81 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  38.39 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  40.61 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  37.7 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  39.38 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  39.24 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1631  rod shape-determining protein RodA  43.87 
 
 		 322 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  39.48 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  42.03 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  41.74 
 
 		 381 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>