More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1758 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 366 aa  734    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  96.17 
 
 		 366 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  77.6 
 
 		 366 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  70.77 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  70.77 
 
 		 366 aa  511  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  68.03 
 
 		 366 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  66.12 
 
 		 366 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  62.84 
 
 		 365 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  47.28 
 
 		 371 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  51.12 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  50 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  50 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  48.92 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  47.7 
 
 		 368 aa  316  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  48.38 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  50.54 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  47.68 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  44.08 
 
 		 365 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  46.59 
 
 		 371 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  49.59 
 
 		 371 aa  295  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  49.32 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  44.88 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  44.78 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  44.5 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  43.9 
 
 		 373 aa  275  9e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  44.23 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  41.83 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  41.57 
 
 		 386 aa  272  7e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  43.58 
 
 		 367 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  43.58 
 
 		 367 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  43.58 
 
 		 367 aa  271  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  42.02 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  43.58 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  45.93 
 
 		 368 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  43.35 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  43.64 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  51.45 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  43.64 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  43.64 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  43.64 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  42.74 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  40.88 
 
 		 379 aa  265  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  52.1 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  44.19 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  44.19 
 
 		 368 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  42.2 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  43.8 
 
 		 368 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  44.31 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  46.8 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  42.82 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  41.81 
 
 		 366 aa  258  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  40.87 
 
 		 371 aa  258  9e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  42.18 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  42.98 
 
 		 376 aa  256  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  43.63 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  41.57 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  43.09 
 
 		 370 aa  253  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  40.93 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.99 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  43.27 
 
 		 382 aa  252  6e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  45.48 
 
 		 372 aa  252  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  42.18 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  42.2 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  42.82 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  45.83 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  42.66 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  43.27 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  42.18 
 
 		 403 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  43.79 
 
 		 373 aa  249  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  248  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  43.32 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  43.82 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  43.21 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  43.21 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  43.21 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  44.64 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  44.64 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  46.56 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  43.92 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  37.36 
 
 		 369 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  44.48 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  45.24 
 
 		 380 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  45.24 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  44.35 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  43.11 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  40.05 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  43.71 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  40.91 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  44.77 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>