More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1108 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 367 aa  730    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  39.6 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  38.76 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  38.76 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  37.64 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  39.04 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  38.95 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  40.98 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  41.53 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  39.55 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  37.36 
 
 		 379 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  38.72 
 
 		 365 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  39.15 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  39.77 
 
 		 384 aa  232  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  37.91 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  39.5 
 
 		 366 aa  228  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  37.29 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  38.38 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  38.33 
 
 		 366 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  38.06 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  39.09 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  36.8 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  37.36 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  38.27 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  38.6 
 
 		 368 aa  219  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  37.87 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  37.99 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  37.03 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1604  rod shape-determining protein RodA  37.92 
 
 		 379 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  36.13 
 
 		 357 aa  215  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  42.91 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  37.08 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  39.06 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  37.65 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.75 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  37.94 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  39.13 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  36.27 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  35.38 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  36.65 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  36.64 
 
 		 371 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  34.07 
 
 		 403 aa  209  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.6 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 362 aa  209  8e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  35.82 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  36.94 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 		 364 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  40.88 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  37.72 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  36.27 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  36.6 
 
 		 368 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  38.86 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.6 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.6 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.6 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  35.45 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 382 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  34.67 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.57 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  35.33 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  34.67 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  34.67 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  39.6 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  34.66 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  38.53 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  36.87 
 
 		 369 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  37.43 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  38.75 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  34.67 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  36.87 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0236  cell wall shape-determining protein  39.73 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  39.58 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  37.78 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  32.91 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  36.03 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  35.36 
 
 		 380 aa  199  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 380 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  37.95 
 
 		 359 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  33.88 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  36.42 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  36.81 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>