More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1454 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  100 
 
 		 411 aa  818    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00585  putative transmembrane rod shape-determining protein  58.78 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  48.14 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  47.86 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  46.17 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  45.45 
 
 		 427 aa  355  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  45.63 
 
 		 434 aa  351  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  43.03 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  39.48 
 
 		 429 aa  296  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1392  rod shape-determining protein RodA, putative  37.5 
 
 		 485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.011069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  34.9 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  34.66 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 408 aa  202  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.15 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  36.84 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  32.48 
 
 		 421 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  32.85 
 
 		 433 aa  190  5e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  33.6 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  34.03 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  32.06 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  31.98 
 
 		 366 aa  179  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  31.28 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  35.71 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  31.75 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  33.86 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  32.23 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  31.03 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  32.55 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  35.39 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  35.12 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  35.12 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  31.98 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.55 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  30.29 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  30.45 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  30.69 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  30.42 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  30.69 
 
 		 368 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  30.69 
 
 		 368 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  31.75 
 
 		 368 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  30.69 
 
 		 368 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  32.14 
 
 		 368 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  30.2 
 
 		 366 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  31.73 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  30.05 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  30.05 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  32.42 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  29.82 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  29.82 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  29.9 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  31.17 
 
 		 372 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  29.87 
 
 		 438 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  29.47 
 
 		 371 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  29.9 
 
 		 380 aa  163  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  30.07 
 
 		 438 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  31.35 
 
 		 373 aa  163  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  32.42 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  29.74 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  29.74 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  30.23 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  33.6 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  33.53 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  31.41 
 
 		 369 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  31.97 
 
 		 360 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  31.54 
 
 		 370 aa  159  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 390 aa  159  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 390 aa  159  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  30.83 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  32.46 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  33.74 
 
 		 423 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  34.1 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  34.1 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  34.1 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  34.1 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  33.71 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  34.1 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  34.1 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  33.14 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  29.19 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  32.57 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  30.33 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  33.14 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>