More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3304 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  100 
 
 		 434 aa  861    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  53.76 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  53.33 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  44.72 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  50.24 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  45.12 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  44.1 
 
 		 411 aa  342  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  45.62 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00585  putative transmembrane rod shape-determining protein  44.71 
 
 		 417 aa  326  6e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1392  rod shape-determining protein RodA, putative  39.75 
 
 		 485 aa  319  5e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.011069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  36.12 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  37.47 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  36.22 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  35.05 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  38.57 
 
 		 412 aa  206  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  37.03 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  33.82 
 
 		 365 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  33.81 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  35.29 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  29.18 
 
 		 380 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  33.6 
 
 		 379 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  32.19 
 
 		 433 aa  187  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  33.17 
 
 		 426 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  31.86 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  31.86 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  34.78 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  29.35 
 
 		 366 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  30.86 
 
 		 366 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  30.72 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  32.21 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  32.61 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  33.81 
 
 		 378 aa  179  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  33.05 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  30.48 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  31.48 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  33.74 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  30.2 
 
 		 371 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  32.1 
 
 		 366 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  32.77 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  30.56 
 
 		 374 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  30.9 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  32.28 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  31.64 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  32.38 
 
 		 353 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  29.7 
 
 		 366 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  32.09 
 
 		 373 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  29.14 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  28.61 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  32.96 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  31.11 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  30.81 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  30.81 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  30.81 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  30.81 
 
 		 368 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  30.81 
 
 		 368 aa  170  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  29.21 
 
 		 367 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  32.51 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  33.6 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  33.6 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  33.6 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  33.6 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  33.6 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  32.27 
 
 		 384 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  28.71 
 
 		 366 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  30.75 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  36.04 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  32.33 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  36.17 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  33.06 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  29.53 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  29.85 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  28.93 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  28.93 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.93 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  32.62 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  32.62 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  32.62 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  32.62 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  32.62 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  32.62 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  32.62 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  31.88 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  29.85 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  29.48 
 
 		 368 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  29.62 
 
 		 379 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  29.62 
 
 		 379 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  28.8 
 
 		 368 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  30.62 
 
 		 366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  35.65 
 
 		 427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  30.02 
 
 		 377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  36.25 
 
 		 422 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  34.44 
 
 		 371 aa  166  8e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  31.34 
 
 		 390 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  28.93 
 
 		 372 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  29.1 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  31.34 
 
 		 390 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  30.75 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  32.62 
 
 		 370 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  32.62 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  30.03 
 
 		 366 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>