More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4287 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 426 aa  829    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  61.5 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  61.5 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  59.06 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  58.41 
 
 		 437 aa  472  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  54.44 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  57.28 
 
 		 417 aa  461  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  56.2 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  48.14 
 
 		 412 aa  329  6e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  45.41 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  48.92 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  40.89 
 
 		 423 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  44.67 
 
 		 424 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  44 
 
 		 422 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  44.17 
 
 		 424 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  42.25 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  42.82 
 
 		 422 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17001  cell division membrane protein  45.13 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.746049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  38.65 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 365 aa  240  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  39.56 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  39.09 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  42.9 
 
 		 387 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  40.65 
 
 		 378 aa  232  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  42.9 
 
 		 412 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.24 
 
 		 379 aa  226  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  40 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  31.73 
 
 		 376 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  35.9 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.96 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.47 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  35.18 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 		 388 aa  206  8e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  34.93 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.43 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  34.65 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  33.74 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  33.17 
 
 		 379 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  33.74 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  34.8 
 
 		 373 aa  201  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  36.68 
 
 		 387 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  35.87 
 
 		 384 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  35.85 
 
 		 366 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  36.74 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 384 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  40.71 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  36.43 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  32.96 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  34.67 
 
 		 367 aa  196  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  38.82 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  34.06 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  38.84 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  37.84 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  32.08 
 
 		 451 aa  192  6e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  32.84 
 
 		 405 aa  192  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  37.38 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  31.59 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  35.98 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.09 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  36.39 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.67 
 
 		 366 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.56 
 
 		 368 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 		 413 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  37.09 
 
 		 407 aa  189  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  34.31 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  37.91 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.56 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  37.88 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  33.25 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  35.6 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  32.19 
 
 		 380 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 370 aa  187  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  35.14 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  33.17 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  31.12 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  37.25 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  34.98 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  33.64 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1091  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  33.33 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  37.16 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  32.7 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>