More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4584 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  100 
 
 
438 aa  876    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  80.55 
 
 
437 aa  704    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  59.73 
 
 
419 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  57.57 
 
 
417 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  57.57 
 
 
417 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  56.13 
 
 
417 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  54.44 
 
 
426 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  52.97 
 
 
421 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  45.76 
 
 
412 aa  360  4e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  46.3 
 
 
412 aa  354  2e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  47.47 
 
 
427 aa  342  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  42.68 
 
 
422 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  41.19 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  40.95 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  41.71 
 
 
422 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  41.71 
 
 
422 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  38.46 
 
 
423 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17001  cell division membrane protein  42.72 
 
 
426 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.746049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  32.78 
 
 
365 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  41.64 
 
 
412 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  33.81 
 
 
366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  34.66 
 
 
372 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  31.65 
 
 
373 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  35.03 
 
 
451 aa  203  6e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  32.86 
 
 
366 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  32.24 
 
 
367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  33.03 
 
 
382 aa  199  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  35.9 
 
 
387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 
390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  34.66 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  32.62 
 
 
371 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  32.55 
 
 
366 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  38.4 
 
 
418 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  31.96 
 
 
374 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  34.13 
 
 
368 aa  192  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  33.89 
 
 
367 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  33.89 
 
 
367 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  33.81 
 
 
434 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  32.94 
 
 
368 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  33.65 
 
 
367 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  35.5 
 
 
368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  32.03 
 
 
385 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  33.33 
 
 
426 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 
372 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  33.97 
 
 
368 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  32.22 
 
 
374 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  52.98 
 
 
380 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  30.5 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 
368 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 
368 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 
368 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 
368 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  30.32 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  35.24 
 
 
374 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  31.83 
 
 
433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  35.23 
 
 
389 aa  183  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  32.31 
 
 
384 aa  183  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  32.67 
 
 
427 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  32.96 
 
 
366 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  29.5 
 
 
379 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  34.4 
 
 
373 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  30.65 
 
 
378 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 
390 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 
390 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  31.31 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  32.76 
 
 
373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  35.14 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  34.62 
 
 
368 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  31.28 
 
 
360 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  30.81 
 
 
408 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  32.46 
 
 
379 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  32.63 
 
 
382 aa  177  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  29.37 
 
 
371 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  32.53 
 
 
403 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  32.53 
 
 
364 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  32.1 
 
 
384 aa  176  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  49.7 
 
 
369 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  32.15 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  31.98 
 
 
373 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  31.98 
 
 
373 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  32.63 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  47.95 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  47.34 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  31.34 
 
 
408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  30.96 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  30.81 
 
 
412 aa  173  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  28.95 
 
 
407 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  33.62 
 
 
359 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  33.49 
 
 
386 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  50 
 
 
377 aa  172  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  33.78 
 
 
385 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1034  cell cycle protein  32.97 
 
 
402 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  52.63 
 
 
378 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0240  rod shape-determining protein RodA  34.91 
 
 
380 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  32.96 
 
 
379 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  29.75 
 
 
429 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  32.96 
 
 
379 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>