More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1392 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1392  rod shape-determining protein RodA, putative  100 
 
 		 485 aa  968    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.011069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  39.75 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  39.25 
 
 		 426 aa  314  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  39.29 
 
 		 427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  37.02 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  36.79 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  36.81 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  45.53 
 
 		 411 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00585  putative transmembrane rod shape-determining protein  56.74 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  53.76 
 
 		 429 aa  195  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 418 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  29.32 
 
 		 408 aa  170  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  30.36 
 
 		 433 aa  163  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  27.64 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  48.17 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  28.27 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  43.96 
 
 		 366 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  42.41 
 
 		 366 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  47.71 
 
 		 407 aa  153  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  48.8 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0743  rod shape-determining protein RodA  28.22 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0542496  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  46.11 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  30.13 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  46.11 
 
 		 412 aa  146  9e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  48.61 
 
 		 366 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  28.77 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  46.9 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  43.04 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  46.9 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  42.11 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  46.9 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  46.9 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  42.11 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  43.83 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  42.11 
 
 		 367 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  42.11 
 
 		 367 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  44.51 
 
 		 366 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  44.44 
 
 		 367 aa  139  8.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  42.05 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  47.59 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  45.89 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  41.52 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  45.7 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  38.38 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  47.59 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  42.61 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  46.21 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  43.33 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  46.21 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  43.48 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  46.2 
 
 		 404 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  41.52 
 
 		 366 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  40.83 
 
 		 379 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  39.9 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  40.83 
 
 		 379 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  44.83 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  29.87 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  48.61 
 
 		 371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  46.21 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  42.11 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  40.76 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  44.22 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  45.96 
 
 		 366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  41.21 
 
 		 380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  47.92 
 
 		 366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  49.31 
 
 		 366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  44.3 
 
 		 374 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  47.22 
 
 		 366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  42.11 
 
 		 380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  28.18 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  40.68 
 
 		 384 aa  133  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  45.52 
 
 		 376 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  37.5 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  38.2 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  43.75 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000981  rod shape-determining protein RodA  46.9 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  40.74 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  44.76 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  44.76 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  42.53 
 
 		 376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  44.52 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  46.94 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  43.45 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  42.51 
 
 		 360 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  43.84 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  40.74 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1091  rod shape-determining protein RodA  43.05 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  46.9 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  46.98 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  43.75 
 
 		 373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  43.75 
 
 		 373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  45.77 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  41.46 
 
 		 390 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01655  rod shape-determining protein RodA  41.14 
 
 		 253 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  43.14 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  46.53 
 
 		 423 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  37.04 
 
 		 412 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  36.08 
 
 		 373 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  33.2 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  43.15 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>