More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00585 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00585  putative transmembrane rod shape-determining protein  100 
 
 		 417 aa  824    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  58.78 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  50.35 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  44.71 
 
 		 434 aa  364  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  45.97 
 
 		 421 aa  363  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  46.34 
 
 		 426 aa  355  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  45.99 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  39.52 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  40.53 
 
 		 429 aa  292  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1392  rod shape-determining protein RodA, putative  56.74 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.011069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 407 aa  216  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 		 407 aa  216  5e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  35.6 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  37.24 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  38.25 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  32.51 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  31.67 
 
 		 380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  32.05 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  31.74 
 
 		 366 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  32.66 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  34.68 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  32.26 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 368 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 368 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 368 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  32.26 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  32.26 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  31.67 
 
 		 433 aa  182  8.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  34.74 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  31.73 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  32.21 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  34.38 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  31.97 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  32.84 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  32.84 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  32.84 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  28.92 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  30.33 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.79 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  32.35 
 
 		 382 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  32.11 
 
 		 382 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  32.43 
 
 		 370 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  32.43 
 
 		 370 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  32.43 
 
 		 370 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  32.43 
 
 		 370 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  32.43 
 
 		 370 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  31.86 
 
 		 373 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  33.94 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  31.62 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  33.5 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  30.73 
 
 		 374 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  31.89 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  35.42 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  31.38 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  31.46 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  32.11 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  29.72 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  31.89 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  31.89 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  31.89 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  31.89 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  31.89 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  31.89 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  31.89 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  33.01 
 
 		 372 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  31.68 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  30.73 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  29.27 
 
 		 367 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  31.39 
 
 		 366 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  31.62 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  31.51 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  31.22 
 
 		 438 aa  170  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0048  rod shape-determining protein RodA  34.01 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  31.22 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  33.7 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  31.59 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  31.22 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  30.85 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  31.88 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  32.6 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  32.49 
 
 		 369 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  30.51 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  31.01 
 
 		 366 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  31.46 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  31.08 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  29.92 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  32.73 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  33.67 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  31.08 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  31.08 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  30.77 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  33.14 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  30.77 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  29.16 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>