More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1998 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 408 aa  805    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  77.4 
 
 		 407 aa  564  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  64.43 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  63.64 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  64.95 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  58.87 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  62.47 
 
 		 412 aa  477  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  39.63 
 
 		 426 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  39.25 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  36.3 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  35.07 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  41.18 
 
 		 421 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  35.53 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  36.5 
 
 		 411 aa  222  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  37.22 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  34.18 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  34.82 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  33.97 
 
 		 429 aa  220  3e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  33.42 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  33.82 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  34.74 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  34.74 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  35.86 
 
 		 366 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  33.58 
 
 		 378 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  33.52 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  34.8 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 		 366 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  33.16 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  34.63 
 
 		 429 aa  209  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  36.57 
 
 		 423 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.8 
 
 		 422 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  35.7 
 
 		 366 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  34.55 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  36 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.35 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.8 
 
 		 366 aa  206  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  34.07 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  36.12 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  35.85 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  33.58 
 
 		 388 aa  205  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  31.19 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.41 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  34.39 
 
 		 371 aa  202  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  32.81 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  33.41 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  36.68 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  35.6 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  33.83 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  32.84 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  36.76 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  33.17 
 
 		 371 aa  199  7.999999999999999e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  34.38 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  33.76 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  33.85 
 
 		 368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 		 382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  30.83 
 
 		 374 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  34.15 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  31.66 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  35.77 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  34.46 
 
 		 368 aa  196  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  32.65 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  32.59 
 
 		 413 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  34.01 
 
 		 371 aa  192  9e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  34.46 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  35.57 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  34.33 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  34.52 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  34.52 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.2 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  33.59 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  33.33 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  34.02 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  34.02 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  36.43 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  34.02 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  34.2 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  35.79 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  33.59 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  33.59 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  33.59 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 		 373 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  34.66 
 
 		 384 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  33.59 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  33.59 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  33.59 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  33.51 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  35.51 
 
 		 376 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  33.76 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  34.15 
 
 		 384 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  29.58 
 
 		 376 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  34.96 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  34.02 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>