More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0351 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 407 aa  808    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  77.59 
 
 		 408 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  74.69 
 
 		 407 aa  614  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  73.96 
 
 		 412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  67 
 
 		 421 aa  568  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  64.43 
 
 		 408 aa  494  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  62.41 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  36.62 
 
 		 427 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  37.38 
 
 		 419 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  34.37 
 
 		 429 aa  223  3e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  35.36 
 
 		 429 aa  222  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  35.32 
 
 		 426 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  36.63 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  36.63 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.82 
 
 		 366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  36.79 
 
 		 429 aa  219  7.999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.98 
 
 		 373 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  36.87 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  36.95 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  31.77 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.75 
 
 		 417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.75 
 
 		 417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.53 
 
 		 366 aa  213  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.69 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  35.44 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  37.3 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  37.84 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  33.67 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  35 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  32.92 
 
 		 380 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  32.21 
 
 		 451 aa  209  8e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  31.47 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  34.74 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  36.1 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  34.84 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  35.32 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  40.11 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.14 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  30.62 
 
 		 378 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  34.45 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  35.18 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  37.5 
 
 		 412 aa  203  5e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  35.59 
 
 		 421 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  35.97 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  34.66 
 
 		 371 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  35.9 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  34.18 
 
 		 369 aa  200  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  34.45 
 
 		 417 aa  199  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  35.9 
 
 		 373 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.23 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  35 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  34.15 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  35.53 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  33.92 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  35.7 
 
 		 412 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  38.31 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  34.5 
 
 		 412 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  30.81 
 
 		 438 aa  193  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  35.37 
 
 		 373 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  34.56 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.88 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  35.91 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  31.68 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  35.23 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  35.23 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  36.17 
 
 		 373 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 		 372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  34 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  35.68 
 
 		 382 aa  189  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  32.35 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  33.85 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  36.15 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  32.44 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  35.15 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  38.08 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  34.6 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00585  putative transmembrane rod shape-determining protein  36.75 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  36.51 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  32.81 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  33.85 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  31.92 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  32.25 
 
 		 389 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  33.86 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  32.41 
 
 		 438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  31.46 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  33.59 
 
 		 378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  31.68 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  33.08 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  33.08 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  33.08 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  33.66 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  33.08 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>