More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06110 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 404 aa  804    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  60.81 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  58.65 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  43.63 
 
 		 408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  38.85 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  36.13 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.03 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  39.2 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  37.74 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  38.77 
 
 		 378 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 		 371 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  39.25 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 		 388 aa  216  8e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 		 417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  37.9 
 
 		 369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 		 417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  35 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  37.7 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.83 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  38.12 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  34.19 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  36.27 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  35.59 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  36.27 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  41.64 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  38.21 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  34.28 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 		 398 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  38.22 
 
 		 367 aa  202  8e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  37.34 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  35.03 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  35.11 
 
 		 367 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.86 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 		 366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  30.65 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  32.51 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.66 
 
 		 366 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  36.51 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  35.6 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  35.34 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  37.47 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  35.7 
 
 		 407 aa  195  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  35.26 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  34.57 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  32.44 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  38.07 
 
 		 373 aa  192  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  36.49 
 
 		 423 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  35.51 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  33.24 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  32.21 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  34.19 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  38.01 
 
 		 371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  32.49 
 
 		 374 aa  190  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  35.21 
 
 		 387 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  35.14 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 366 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  34.95 
 
 		 509 aa  188  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  37.1 
 
 		 407 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  30.57 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.48 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  33.33 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  36.27 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  37.02 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.16 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  36.24 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  32.28 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  37.02 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  36.24 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  36 
 
 		 382 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  36 
 
 		 382 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  36 
 
 		 382 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  36.29 
 
 		 422 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  36.24 
 
 		 382 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  34.96 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  33.1 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  35.22 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  34.39 
 
 		 370 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  34.48 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  37.16 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  35.38 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  34.51 
 
 		 373 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  36.02 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  36.02 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  35.75 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  32.64 
 
 		 424 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  34.61 
 
 		 421 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0779  cell cycle protein  38.28 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>