More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1672 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  92.4 
 
 		 422 aa  768    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  100 
 
 		 422 aa  821    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  93.6 
 
 		 422 aa  760    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  75.83 
 
 		 423 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  52.45 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  52.2 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17001  cell division membrane protein  55.5 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.746049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  51.41 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  52.41 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  52.41 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  43.42 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  43.4 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  44.01 
 
 		 417 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  44.01 
 
 		 417 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  41.71 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  41.58 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  42.82 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  40.89 
 
 		 437 aa  286  5e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  40.05 
 
 		 378 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  38.14 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  36.98 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  38.8 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  36.86 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.69 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  37.82 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  38.61 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  35.2 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  37.54 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.86 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  37.71 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  37.08 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  34.83 
 
 		 366 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  39.12 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  38.33 
 
 		 366 aa  210  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  38.51 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  36.68 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.67 
 
 		 371 aa  208  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  35.35 
 
 		 407 aa  206  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  36.87 
 
 		 412 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  36.44 
 
 		 379 aa  206  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  34.36 
 
 		 379 aa  206  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  33.87 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  33.87 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  38.17 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  33.09 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  36.96 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  38.36 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 374 aa  203  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  35.52 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.16 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  35.22 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  35.67 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  35.33 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  33.41 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  35.39 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  37.33 
 
 		 412 aa  199  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  36.57 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  33.17 
 
 		 376 aa  199  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.71 
 
 		 387 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 		 382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.26 
 
 		 366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  35.76 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  35.46 
 
 		 370 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  35.46 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  33.52 
 
 		 372 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  38.29 
 
 		 369 aa  196  9e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  36.23 
 
 		 408 aa  196  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  35.26 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  34.08 
 
 		 371 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  34.22 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  33.24 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  33.98 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  39.56 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  33.98 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  34.12 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  35.28 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  34.62 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  36 
 
 		 367 aa  193  5e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  33.78 
 
 		 385 aa  193  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  32.21 
 
 		 382 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  36.57 
 
 		 373 aa  193  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  34.68 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  32.19 
 
 		 376 aa  192  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  35.53 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  32.16 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  35.2 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  34.28 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>