More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0956 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 382 aa  739    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.92 
 
 		 365 aa  258  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  40.61 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  42.55 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  45.45 
 
 		 401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  41.27 
 
 		 413 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.9 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  41.78 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  40.6 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  39.07 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  39.04 
 
 		 378 aa  222  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  40.18 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.8 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  39.02 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  33.41 
 
 		 417 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  39.27 
 
 		 411 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  32.78 
 
 		 369 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  35.05 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  39.38 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  33.03 
 
 		 438 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  33.97 
 
 		 419 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  42.22 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  36.9 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.18 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  36.16 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  34.49 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  35.36 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  34.49 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  35.69 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  39.36 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.94 
 
 		 369 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  35.28 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.39 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  31.11 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  36.36 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.83 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.83 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  36.46 
 
 		 368 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  34.61 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  34.61 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  32.65 
 
 		 382 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  37.68 
 
 		 380 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  35.81 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  36.63 
 
 		 381 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.74 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.29 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  36.71 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  32.71 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  37.12 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  32.65 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  37.08 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  35.2 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  35.26 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  37.97 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  35.04 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  36.92 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  35.71 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  35.39 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  32.38 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  36.71 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  35.55 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  36.88 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  36.88 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 372 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  34.2 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  38.86 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  36.39 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  35.04 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  40 
 
 		 380 aa  186  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  33.33 
 
 		 370 aa  186  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  33.96 
 
 		 370 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  35.87 
 
 		 380 aa  185  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  31.4 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  35.43 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  33.78 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  34.88 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  34.38 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  33.43 
 
 		 361 aa  182  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1034  cell cycle protein  33.62 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4806  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  0.152125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  36.96 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.53 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  35.18 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4681  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  33.52 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>