More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1684 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 381 aa  735    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  53.35 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  49.31 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  48.49 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  49.74 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  46.77 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  44.97 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  46.09 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  49.05 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  44.62 
 
 		 411 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  39.95 
 
 		 365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.8 
 
 		 380 aa  235  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  34.59 
 
 		 379 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  44.28 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  36.39 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  38.98 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  38.02 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  39.89 
 
 		 367 aa  222  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  40.81 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.62 
 
 		 376 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0825  cell cycle protein  39.19 
 
 		 364 aa  219  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0999607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  37.7 
 
 		 378 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  41.08 
 
 		 364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 368 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 368 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 368 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1691  cell cycle protein FtsW  33.59 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.951767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  34.16 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  39.21 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  37.95 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  42.3 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  39.51 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  38.32 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4064  stage V sporulation protein E  39.02 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  33.69 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  39.39 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  37.65 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  38.74 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  38.74 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  35.69 
 
 		 369 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  39.41 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  39.09 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  38.02 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  38.57 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  36.04 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  37.73 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  38.81 
 
 		 417 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  39.7 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  38.81 
 
 		 417 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  38.39 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.01 
 
 		 422 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  40.66 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  40.96 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  34.98 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  39.4 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  40.66 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  38.12 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  36.49 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  35.34 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.4 
 
 		 388 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  39.76 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  38.3 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  36.9 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  37.4 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  42.41 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  38.02 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  36.12 
 
 		 371 aa  202  6e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  35.91 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.46 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  35.42 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  38.3 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  34.4 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  37.69 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  38.76 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35.11 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  35.42 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  38.55 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  39.76 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  35.66 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  33.7 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  35.47 
 
 		 422 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  33.7 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  37.98 
 
 		 370 aa  199  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.69 
 
 		 369 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 		 371 aa  199  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  34.62 
 
 		 422 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  35.63 
 
 		 374 aa  199  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  36.66 
 
 		 366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  37.81 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  35.94 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>