More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1215 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  88.05 
 
 		 411 aa  679    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  100 
 
 		 411 aa  813    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  55.56 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  58.67 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  47.13 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  47.57 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  48.66 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  48.81 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  44.73 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  48.66 
 
 		 407 aa  269  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  44.62 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.27 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11520  rod shape-determining protein RodA  44.24 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0049464  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  39.1 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  35.6 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  38.32 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  39.36 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.69 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  35.39 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  36.48 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  42.08 
 
 		 378 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.67 
 
 		 387 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  35.89 
 
 		 398 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  35.45 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  40.53 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.24 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.24 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  35.85 
 
 		 366 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  32.78 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  34.71 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.03 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  32.99 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  38.83 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.03 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.68 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  32.98 
 
 		 367 aa  198  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  33.06 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  33.41 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  31.9 
 
 		 408 aa  195  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.77 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  33.72 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  35.41 
 
 		 391 aa  193  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  32.77 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.32 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  33.24 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  35.58 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  36.46 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3957  stage V sporulation protein E  36.31 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3762  stage V sporulation protein E  36.31 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3653  stage V sporulation protein E  36.31 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3670  stage V sporulation protein E  36.31 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3964  stage V sporulation protein E  36.31 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4050  stage V sporulation protein E  36.31 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3926  stage V sporulation protein E  36.04 
 
 		 363 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000164467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  36.04 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.72 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  32.13 
 
 		 407 aa  189  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  34.67 
 
 		 368 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  30.41 
 
 		 374 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  37 
 
 		 366 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  32.8 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  34.77 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  31.14 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  33.69 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1229  stage V sporulation protein E  35.77 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000285067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4012  stage V sporulation protein E  35.5 
 
 		 363 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000045407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  34.75 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  32.89 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  32.53 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  36.05 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  34.74 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  36.07 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  35.13 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  34.04 
 
 		 375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  31.71 
 
 		 371 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  33.15 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  33.98 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  34.23 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  32.97 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2561  stage V sporulation protein E  37.36 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.119412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.69 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4083  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  31.27 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  33.78 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  34.25 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  33.17 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  33.51 
 
 		 370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1258  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  31.22 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  33.77 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  36.44 
 
 		 369 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  34.52 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  33.76 
 
 		 386 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>